Die Gelenkflächen sind durch knöcherne oder bandbedingte Störungen nicht mehr passend zueinander ausgerichtet.

Die Gelenkinkongruenz kann durch Dysplasien angeboren sein oder entsteht durch Verletzungen oder entzündliche Veränderungen, so dass die in einem Gelenk passend zueinander angeordneten Gelenkflächen nicht mehr korrekt gegenüberliegen und die Gelenkfunktion gestört ist. Dies führt zur so genannten Inkongruenzarthrose, häufig am oberen Sprunggelenk nach Verletzung der tibiofibularen Syndesmose, und zur Inkongruenz der Sprunggelenkgabel.